J'ai vu passer un tuto sur chroot (qui est plutôt didactique, c'est bien) sur shaarli.fr (http://karma-lab.net/magie-chroot). Et chroot est en effet une bénédiction :p
C'est très bien pour lancer des applications qui n'ont pas besoin d'une interface graphique, mais vous pouvez être amené à vouloir lancer une application avec une interface graphique. C'est souvent le cas si vous êtes sous un Linux récent et que vous voulez installer une application qui n'a pas été mise à jour depuis un moment.... qui ne fonctionne donc pas sur votre système.
Dans ce cas, vous devez faire la manipulation suivante (attention, cela désactive une option de sécurité de X ; même si le risque est faible que quoi que ce soit exploite cette ouverture, il faut en avoir conscience) :
Le document en lien précise plusieurs autres commandes qui peuvent vous être utiles.
Pour réactiver la protection, dans le terminal système entrer : xhost -